Der Schweizer Kunst widmet Koller seit 2006 zwei mal jährlich spezielle Auktionen mit entsprechenden Katalogen. Bedeutende Werke der berühmtesten Schweizer Künstler von Ferdinand Holder, Giovanni, Augusto, Alberto und Diego Giacometti über Félix Vallotton und Cuno Amiet bis zu wichtigen Gemälden von Robert Zünd und Albert Anker stehen ebenso im Angebot wie Gemälde von Alice Bailly, Adolf Dietrich, Ernest Biéler oder Eduard Gubler. Die eingeschlagene Strategie, Schweizer Kunst getrennt von den Gemälden und Skulpturen inter-nationaler Künstler zu versteigern, schlägt sich in einem stetig wachsenden Angebot und vielen erzielten Spitzenpreisen nieder.